De conformidad con los Arts. 3.1. y 3.3., literal c) del Convenio Constitutivo del Fondo Indígena, el Consejo Directivo es su órgano gubernativo y autoridad administrativa, cuya máxima autoridad en ambas materias, la ejerce la Presidencia del Consejo Directivo cuando este órgano no está en reunión colegiada.
En tal calidad, tiene como funciones generales las de dirección, planificación estratégica, coordinación, control, seguimiento y evaluación de las realizaciones del Fondo en el mediano y corto plazo.
En el ejercicio de estas funciones, el Consejo sigue las directrices emanadas de los actos de la Asamblea, y considera las sugerencias del Secretariado Técnico en los ámbitos de su competencia.
En el ejercicio de estas facultades, el Consejo representa al Fondo Indígena, sin perjuicio de las facultades privativas de la Asamblea y dentro de las directrices de ésta como órgano supremo del Fondo.
En las Asambleas Generales en las que se elige a los miembros del Consejo Directivo, se celebra una sesión de éste para elegir al Presidente y a los Vicepresidentes. Dicha elección se somete a la ratificación de la Asamblea.
El Consejo Directivo está compuesto por: tres de los representantes de los Estados Extrarregionales acreditados en la Asamblea, por los representantes gubernamentales de tres de los Estados Regionales, y por los representantes de los Pueblos Indígenas de seis de los Estados Regionales, todos ellos debidamente acreditados en la Asamblea. No podrán ser miembros del Consejo Directivo más de un representante por país.
La participación de los representantes en el Consejo Directivo procura un carácter rotativo, alternable y que se rija por el sistema de turno entre países.
Delegado Indígena de Colombia
Delegado Gubernamental de Guatemala
Delegado del Reino de Bélgica
Ministro Relaciones Exteriores
ECUADORSecretario Ejecutivo CODENPE
GUATEMALAMinistro de Cultura y Deportes
BÉLGICAMinisterio Relaciones Exteriores
ESPAÑAJefa Depto. Cooperación Países Andinos y Cono Sur
PORTUGALInstituto Português de Apoio ao Desenvolvimento Divisão dos Assuntos Multilaterais
Organizaciones aborígenes de Jujuy
CHILEPueblo Mapuche
COLOMBIAOrganización Nacional Indígena de Colombia
COSTA RICAMesa Nacional Indígena de Costa Rica
EL SALVADORConsejo Coordinador Nacional Indígena Salvadoreño
PANAMACoordinadora Nacional Indígena de Panamá