El programa de formación y capacitación, busca fortalecer las capacidades de los Pueblos Indígenas para participar activamente en la gestión del desarrollo indígena, a nivel local, nacional y regional.
El programa incluye tres sub-componentes: (i) Universidad Indígena Intercultural-UII, como un sistema de Educación Superior para América Latina y El Caribe y (ii) Programa de la Escuela Intercultural de Gobierno y Políticas Públicas para América Latina y El Caribe- EIGPP, iii) Cursos en Línea junto con la UIT (Unión Internacional de Telecomunicaciones).
Estos componentes buscan la construcción de un sistema de gestión, facilitación, producción y aplicación del conocimiento que estimule la revalorización, el desarrollo y la construcción el pensamiento propio, la profundización y canalización del conocimiento de los líderes indígenas en áreas que les facilite el acceso y ejercicio del poder político en todos los ámbitos de la democracia formal en cada país y la región, la consolidación de un programa permanente con cobertura para todos los indígenas de América Latina formando dirigentes, hombre y mujeres, en igualdad de condiciones, respetando y potenciando su identidad cultural y derechos en lo regional, nacional y local.